複合タンパク質（ ふくごうたんぱくしつ、英：conjugated protein ） 体内の複合タンパク質で最も多いのはヘモグロビンで、その次が高/低密度リポタンパク質となる。 以下は複合タンパク質を簡単に表したものとなる。 種 類 結合しているもの 例 働 き 1 糖タンパク質 糖（オリゴ糖） 抗体、ホルモン、ムチン 細胞認識、分泌、免疫など 2 リポタンパク質 脂質 HDL, LDL 脂質の輸送 3 クロモタンパク質 色素（例：ヘム） ヘモグロビン、シトクロム 酸素運搬、電子伝達 4 ヌクレオタンパク質 核酸（DNA/RNA） リボソーム、ヒストン タンパク合成、遺伝子制御 5 リンタンパク質 リン酸基 カゼイン（牛乳）、酵素群 構造安定化、調節機能 6 金属タンパク質 金属イオン （Fe, Zn, Cuなど） フェリチン、カタラーゼ 酸化還元反応、酵素活性中心
